うちのクラスタのよくあるスペック(4コアのXeon E5530が二つで計8コア)用にスクリプトを書いてみる。 for N in 1 2 4 8 16; do cat > temp <

もっと真面目にMatrix Market形式のヘッダについて書いてみようと思う。 まず前提として、Matrix Market形式ではスペースの個数とか大文字小文字の区別はない。で、ヘッダは1行目。 ヘッダの概要 %%MatrixMarket matrix <format> <field> <symmetry> format フォーマットは疎行列形式</symmetry></field></format>…

今計算しようとしている行列は実はこんなのだ %%MatrixMarket matrix coordinate real symmetric N N lines 1 1 val 2 1 val ... m 1 val 2 2 val 5 2 val ...symmetricはともかく、これだと縦分割になってしまって、横分割を基本とするCRSには適していない…

現在疎行列ベクトル積のプログラムを書く途中なので、よく使われる疎行列の表現形式の一つである（らしい）Matrix Market形式(略してMMらしい)のリファレンス*1を参照しつつ適当に翻訳っぽいものをしてみる。 Introduction 疎行列の座標形式(Coordinate Form…

本当はTim Davis: SuiteSparse Matrix Collection : sparse matrices from a wide range of applicationsを計算する予定でMatrix Market記法を見てみたのだけど、どうもCRSに向いてないような気がしてきたのでもう一つの使用されている形式であるRutherford …